Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COMMD3Q9UBI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COMMD3Q9UBI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COMMD3Q9UBI1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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