Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFY2Q9P0M6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2AFY2Q9P0M6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 741 ms