Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUB1

ACSS1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1Q9NUB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSS1Q9NUB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSS1Q9NUB1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS1Q9NUB1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSS1Q9NUB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms