Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6BQ9NRW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms