Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRC4Q9NPP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRC4Q9NPP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms