Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLCO1B3Q9NPD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1B3Q9NPD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms