Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A3Q9H7F0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms