Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTR3CQ9C0K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTR3CQ9C0K3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms