Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL4Q9C0H6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms