Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KATNB1Q9BVA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms