Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC1Q9BTT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC1Q9BTT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms