Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTERF3Q96E29 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms