Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM54Q969K7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM54Q969K7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms