Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms