Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC83Q8IWF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms