Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNEQ86WN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms