Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG4

HMGN2P46, Putative Dresden prostate carcinoma protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P46Q86SG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN2P46Q86SG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P46Q86SG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGN2P46Q86SG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms