Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HRCT1Q6UXD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HRCT1Q6UXD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HRCT1Q6UXD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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