Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ULK3Q6PHR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms