Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8BQ6P9F7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8BQ6P9F7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms