Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB12Q6IQ22 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms