Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF8Q5VWM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms