Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF3Q5VWG9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF3Q5VWG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms