Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARNL3Q5VVW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms