Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM35AQ53FP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms