Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops9Q3U898 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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