Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITSN1Q15811 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITSN1Q15811 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITSN1Q15811 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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