Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAM1Q15629 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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