Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BECN1Q14457 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BECN1Q14457 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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