Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB3Q13509 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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