Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 RPN7YPR108W 1290 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 MRPS5YBR251W 924 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YEL020CYEL020C 1683 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 LYS21YDL131W 1323 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 CIS3YJL158C 684 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YNR040WYNR040W 771 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YPL277CYPL277C 1464 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 PFK2YMR205C 2880 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 IMA5YJL216C 1746 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 RSA4YCR072C 1548 nt5.74□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 PAT1YCR077C 2391 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 NSE5YML023C 1671 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SKN1YGR143W 2316 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 SIT4YDL047W 936 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 COX20YDR231C 618 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YNL017CYNL017C 339 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 RMD9YGL107C 1941 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 CNE1YAL058W 1509 nt5.73□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 COX9YDL067C 180 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 MED6YHR058C 888 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YIL077CYIL077C 963 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 EFM3YJR129C 1020 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 AFG1YEL052W 1530 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 GDA1YEL042W 1557 nt5.72□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 QNS1YHR074W 2145 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 RRP46YGR095C 672 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 ECM19YLR390W 339 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 SAC6YDR129C 1929 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 PRP24YMR268C 1335 nt5.71□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 RPN11YFR004W 921 nt5.7□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 KDX1YKL161C 1302 nt5.7□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 MNS1YJR131W 1650 nt5.69□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 HAP2YGL237C 798 nt5.69□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 FAF1YIL019W 1041 nt5.69□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 DJP1YIR004W 1299 nt5.69□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 YOL036WYOL036W 2286 nt5.69□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 LSG1YGL099W 1923 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 PPM1YDR435C 987 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 YJU3YKL094W 942 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 YLR126CYLR126C 756 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 UBC11YOR339C 471 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 UIP4YPL186C 915 nt5.68□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 DFM1YDR411C 1026 nt5.67□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 STE13YOR219C 2796 nt5.67□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 RAD3YER171W 2337 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 YER186CYER186C 921 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 RPE1YJL121C 717 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 YML6YML025C 861 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 GIT1YCR098C 1557 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 VPS4YPR173C 1314 nt5.66□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 UGX2YDL169C 672 nt5.65□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 PRS2YER099C 957 nt5.65□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 AAD15YOL165C 432 nt5.65□□□□□ -1.5
RRP42Q12277 BZZ1YHR114W 1902 nt5.65□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 APE3YBR286W 1614 nt5.65□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 COR1YBL045C 1374 nt5.65□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 CDC16YKL022C 2523 nt5.65□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 GAT1YFL021W 1533 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YPK2YMR104C 2034 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 BUD9YGR041W 1644 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 AVO2YMR068W 1281 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 VMA4YOR332W 702 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 PKC1YBL105C 3456 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 SNU71YGR013W 1863 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 VRP1YLR337C 2454 nt5.64□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 ESC8YOL017W 2145 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 PCS60YBR222C 1632 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 COG1YGL223C 1254 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YBR144CYBR144C 315 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 XBP1YIL101C 1944 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YDR514CYDR514C 1452 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 MSS1YMR023C 1581 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 HSP78YDR258C 2436 nt5.63□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 IRS4YKR019C 1848 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YDR109CYDR109C 2148 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 RPS2YGL123W 765 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 NPA3YJR072C 1158 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 ATG12YBR217W 561 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 ISN1YOR155C 1353 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 DIA3YDL024C 1407 nt5.62□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 MRK1YDL079C 1506 nt5.61□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 DUG1YFR044C 1446 nt5.61□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 RME1YGR044C 903 nt5.61□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 LYS12YIL094C 1116 nt5.61□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 RPL10YLR075W 666 nt5.61□□□□□ -1.51
RRP42Q12277 TAL1YLR354C 1008 nt5.61□□□□□ -1.51
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