Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 TAN1YGL232W 870 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 IMP3YHR148W 552 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR049CYLR049C 1287 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ECM13YBL043W 774 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NSG2YNL156C 900 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 INP54YOL065C 1155 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NOB1YOR056C 1380 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ABP1YCR088W 1779 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ATG32YIL146C 1590 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YDR132CYDR132C 1488 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 QRI7YDL104C 1224 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SLU7YDR088C 1149 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YBL036CYBL036C 774 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SAS2YMR127C 1017 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NCE103YNL036W 666 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SUR1YPL057C 1149 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 IPL1YPL209C 1104 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YNR066CYNR066C 1311 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 CEG1YGL130W 1380 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 DFG5YMR238W 1377 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 PFS2YNL317W 1398 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YEL028WYEL028W 462 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ERG26YGL001C 1050 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SPO74YGL170C 1242 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 PRP21YJL203W 843 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 IMD1YAR073W 1212 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YMR010WYMR010W 1218 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 CAF40YNL288W 1122 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 CPR8YNR028W 927 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NTG2YOL043C 1143 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 CKB2YOR039W 777 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YBR053CYBR053C 1077 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YPR012WYPR012W 255 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 TMS1YDR105C 1422 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SRO9YCL037C 1305 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SNU71YGR013W 1863 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 RVS161YCR009C 798 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 Q0032Q0032 291 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 FLX1YIL134W 936 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 TFA2YKR062W 987 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 RPL10YLR075W 666 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR156WYLR156W 345 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR159WYLR159W 345 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YLR161WYLR161W 345 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 SHE1YBL031W 1017 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NRK1YNL129W 723 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 HIS3YOR202W 663 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 PEX3YDR329C 1326 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 HSV2YGR223C 1347 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ABD1YBR236C 1311 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 LPD1YFL018C 1500 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 NRG1YDR043C 696 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YFR020WYFR020W 699 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ALB1YJL122W 528 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YJR157WYJR157W 363 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 LAC1YKL008C 1257 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 CPR6YLR216C 1116 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YAR069CYAR069C 294 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 MTF1YMR228W 1026 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YBL071CYBL071C 309 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 PDR16YNL231C 1056 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 MDH2YOL126C 1134 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 TAH18YPR048W 1872 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 RUD3YOR216C 1455 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 MAK11YKL021C 1407 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YCR108CYCR108C 192 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 MRPL25YGR076C 474 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 STS1YIR011C 960 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 MFT1YML062C 1179 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ATG16YMR159C 453 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 GAL7YBR018C 1101 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 RRP7YCL031C 894 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 DHH1YDL160C 1521 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 ALG1YBR110W 1350 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 YDL124WYDL124W 939 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 GLC7YER133W 939 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 YGL132WYGL132W 336 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 PEX14YGL153W 1026 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 SMD3YLR147C 306 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 YAR053WYAR053W 297 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 NBP1YLR457C 960 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 SPC2YML055W 537 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 RFC4YOL094C 972 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 MGE1YOR232W 687 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 FDH1YOR388C 1131 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 TAF3YPL011C 1062 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 YBR071WYBR071W 636 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BLQ12266 ELP3YPL086C 1674 nt7.21□□□□□ -1.26
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