Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP4Q07065 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP4Q07065 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms