Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF90Q03938 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms