Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 YPR123CYPR123C 435 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YBR226CYBR226C 411 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 GFA1YKL104C 2154 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 ISN1YOR155C 1353 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SLX5YDL013W 1860 nt5.77□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 FRS2YFL022C 1512 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 ERP5YHR110W 639 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SNN1YNL086W 309 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 UBC11YOR339C 471 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 DAP1YPL170W 459 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 EMW1YNL313C 2715 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 NOG2YNR053C 1461 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 CDC16YKL022C 2523 nt5.76□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 MCM3YEL032W 2916 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 EHD3YDR036C 1503 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 HXT15YDL245C 1704 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 HXT16YJR158W 1704 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 SPO7YAL009W 780 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 ATG12YBR217W 561 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 COR1YBL045C 1374 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 MNN5YJL186W 1761 nt5.75□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 MRK1YDL079C 1506 nt5.74□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 BNS1YGR230W 414 nt5.74□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 ARA2YMR041C 1008 nt5.74□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YDL172CYDL172C 480 nt5.73□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 RSC30YHR056C 2652 nt5.73□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 LDB19YOR322C 2457 nt5.73□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 MPA43YNL249C 1629 nt5.73□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 CEF1YMR213W 1773 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 HAP2YGL237C 798 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 PHB1YGR132C 864 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YBR144CYBR144C 315 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 LAG2YOL025W 1983 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 MKK1YOR231W 1527 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 PUF3YLL013C 2640 nt5.72□□□□□ -1.49
CCE1Q03702 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 RRP46YGR095C 672 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 SYF2YGR129W 648 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 DJP1YIR004W 1299 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 CCP1YKR066C 1086 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YPL102CYPL102C 303 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 MTF2YDL044C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 VRP1YLR337C 2454 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YER186CYER186C 921 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 CBP4YGR174C 513 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YUR1YJL139C 1287 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 RAP1YNL216W 2484 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 POP1YNL221C 2628 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 BUD9YGR041W 1644 nt5.7□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 GDA1YEL042W 1557 nt5.69□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 MDH3YDL078C 1032 nt5.69□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 ACS1YAL054C 2142 nt5.69□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 SKI2YLR398C 3864 nt5.69□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YHL017WYHL017W 1599 nt5.68□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 GLE1YDL207W 1617 nt5.68□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YJU3YKL094W 942 nt5.68□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 AMD1YML035C 2433 nt5.68□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 CSC1YLR241W 2349 nt5.68□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 ATF1YOR377W 1578 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YME1YPR024W 2244 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 ELP3YPL086C 1674 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 LYS12YIL094C 1116 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YJL211CYJL211C 444 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 SNO4YMR322C 714 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 HSP33YOR391C 714 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 HSP32YPL280W 714 nt5.67□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 HXK2YGL253W 1461 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YPK2YMR104C 2034 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 snR82snR82 268 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 PAN6YIL145C 930 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 MTC2YKL098W 1074 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 YBR124WYBR124W 360 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 ACC1YNR016C 6702 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 APE3YBR286W 1614 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 NSE5YML023C 1671 nt5.66□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 GIT1YCR098C 1557 nt5.65□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 RPN11YFR004W 921 nt5.65□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 NPA3YJR072C 1158 nt5.65□□□□□ -1.5
CCE1Q03702 RAD3YER171W 2337 nt5.65□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 EEB1YPL095C 1371 nt5.65□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 CNE1YAL058W 1509 nt5.64□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 YDL119CYDL119C 924 nt5.64□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 ICT1YLR099C 1185 nt5.64□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 CSL4YNL232W 879 nt5.64□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 RPS9AYPL081W 594 nt5.64□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 YFR006WYFR006W 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 KNS1YLL019C 2214 nt5.63□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 YCL065WYCL065W 369 nt5.63□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 COX9YDL067C 180 nt5.63□□□□□ -1.51
CCE1Q03702 YDL114WYDL114W 927 nt5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms