Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR3Q03167 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms