Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 SOH1YGL127C 384 nt5.6□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.6□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 MCM6YGL201C 3054 nt5.6□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 KEX2YNL238W 2445 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 DEF1YKL054C 2217 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 OSW2YLR054C 2175 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 SPT3YDR392W 1014 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 TMT1YER175C 900 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 SKG1YKR100C 1068 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 YMR122CYMR122C 375 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 YMC1YPR058W 924 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 YBR124WYBR124W 360 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 SRP101YDR292C 1866 nt5.59□□□□□ -1.51
NUP116Q02630 FAT3YKL187C 2253 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 EXG1YLR300W 1347 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YDR187CYDR187C 519 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 PRE3YJL001W 648 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 PSR2YLR019W 1194 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 SEN34YAR008W 828 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 TAE1YBR261C 699 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 AMD2YDR242W 1650 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 SET5YHR207C 1581 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 CDC1YDR182W 1476 nt5.58□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 BUG1YDL099W 1026 nt5.57□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 RPT3YDR394W 1287 nt5.57□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 HSP150YJL159W 1242 nt5.57□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 AAT2YLR027C 1257 nt5.57□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 RPS3YNL178W 723 nt5.57□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 SKN1YGR143W 2316 nt5.56□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 RPE1YJL121C 717 nt5.56□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 SNN1YNL086W 309 nt5.56□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 MRP51YPL118W 1035 nt5.56□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 GUP2YPL189W 1830 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YGL072CYGL072C 360 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 TDH2YJR009C 999 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 DAP1YPL170W 459 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YMR027WYMR027W 1413 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 DDC1YPL194W 1839 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YLL067CYLL067C 3618 nt5.55□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 GEX1YCL073C 1848 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YJL211CYJL211C 444 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 GLC8YMR311C 690 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YNL108CYNL108C 813 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 UIP4YPL186C 915 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 ILV1YER086W 1731 nt5.54□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 MCH1YDL054C 1461 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 AVO1YOL078W 3531 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 MPC2YHR162W 390 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 RPL10YLR075W 666 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 GEP5YLR091W 882 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 CRF1YDR223W 1404 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 CLB1YGR108W 1416 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 VMS1YDR049W 1899 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 STE13YOR219C 2796 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 EEB1YPL095C 1371 nt5.53□□□□□ -1.52
NUP116Q02630 RVB2YPL235W 1416 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SEC18YBR080C 2277 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YDL172CYDL172C 480 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SDH4YDR178W 546 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ERP5YHR110W 639 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ELA1YNL230C 1140 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 GEX2YKR106W 1848 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 GAT1YFL021W 1533 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YTP1YNL237W 1380 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 QNS1YHR074W 2145 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YPR196WYPR196W 1413 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 AAP1YHR047C 2571 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YDR396WYDR396W 501 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 VPS24YKL041W 675 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 RPO26YPR187W 468 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 EIS1YMR031C 2532 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 PYC2YBR218C 3543 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SSK1YLR006C 2139 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 CHO1YER026C 831 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ECM14YHR132C 1293 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YJL171CYJL171C 1191 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SWP1YMR149W 861 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 CRZ1YNL027W 2037 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SIT1YEL065W 1887 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 TNA1YGR260W 1605 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 BCY1YIL033C 1251 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YOL131WYOL131W 327 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 GPA2YER020W 1350 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 MKK2YPL140C 1521 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 YCK1YHR135C 1617 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 GUD1YDL238C 1470 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 MSP1YGR028W 1089 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ZRT2YLR130C 1269 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms