Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRPAP78324 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIRPAP78324 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms