Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF3P57682 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF3P57682 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF3P57682 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF3P57682 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF3P57682 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF3P57682 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF3P57682 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF3P57682 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF3P57682 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF3P57682 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF3P57682 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF3P57682 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF3P57682 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF3P57682 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF3P57682 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF3P57682 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF3P57682 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF3P57682 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF3P57682 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms