Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFV3P56181 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms