Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA3P52797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms