Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMSP52788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMSP52788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMSP52788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMSP52788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMSP52788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMSP52788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMSP52788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMSP52788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMSP52788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMSP52788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMSP52788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMSP52788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms