Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3P51812 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3P51812 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms