Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA4P51532 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SMARCA4P51532 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA4P51532 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms