Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A2P50993 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A2P50993 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms