Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT3P49368 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT3P49368 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT3P49368 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT3P49368 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT3P49368 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT3P49368 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT3P49368 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT3P49368 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT3P49368 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT3P49368 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT3P49368 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT3P49368 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT3P49368 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT3P49368 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT3P49368 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT3P49368 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT3P49368 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT3P49368 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT3P49368 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT3P49368 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT3P49368 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT3P49368 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT3P49368 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT3P49368 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT3P49368 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT3P49368 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT3P49368 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT3P49368 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT3P49368 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT3P49368 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms