Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNC1P48547 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC1P48547 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms