Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP2P42575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP2P42575 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP2P42575 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP2P42575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP2P42575 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP2P42575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP2P42575 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP2P42575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP2P42575 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP2P42575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP2P42575 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP2P42575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP2P42575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASP2P42575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP2P42575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP2P42575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP2P42575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP2P42575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP2P42575 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP2P42575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP2P42575 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP2P42575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP2P42575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP2P42575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP2P42575 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP2P42575 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP2P42575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP2P42575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP2P42575 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP2P42575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP2P42575 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP2P42575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP2P42575 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP2P42575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP2P42575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP2P42575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP2P42575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP2P42575 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP2P42575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms