Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASIPP42127 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASIPP42127 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASIPP42127 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASIPP42127 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASIPP42127 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASIPP42127 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASIPP42127 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASIPP42127 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASIPP42127 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASIPP42127 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASIPP42127 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASIPP42127 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASIPP42127 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASIPP42127 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASIPP42127 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASIPP42127 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASIPP42127 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASIPP42127 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms