Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GUF1YLR289W 1938 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 NHA1YLR138W 2958 nt5.58□□□□□ -1.52
DDI1P40087 HSP78YDR258C 2436 nt5.57□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YJU3YKL094W 942 nt5.57□□□□□ -1.52
DDI1P40087 TAL1YLR354C 1008 nt5.57□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YHM2YMR241W 945 nt5.57□□□□□ -1.52
DDI1P40087 IRS4YKR019C 1848 nt5.57□□□□□ -1.52
DDI1P40087 RAD3YER171W 2337 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 GPD1YDL022W 1176 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 OM45YIL136W 1182 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 TSA1YML028W 591 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 FSF1YOR271C 984 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 HST2YPL015C 1074 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 PAP2YOL115W 1755 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 RIM101YHL027W 1878 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 ATP1YBL099W 1638 nt5.56□□□□□ -1.52
DDI1P40087 CYS4YGR155W 1524 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 MRPL35YDR322W 1104 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YER186CYER186C 921 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 LCL3YGL085W 825 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 MHT1YLL062C 975 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 MRPS18YNL306W 654 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 TRP3YKL211C 1455 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 TBF1YPL128C 1689 nt5.55□□□□□ -1.52
DDI1P40087 GPD2YOL059W 1323 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 MCM3YEL032W 2916 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 RAD59YDL059C 717 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 IDP1YDL066W 1287 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YJL193WYJL193W 1209 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 LDB7YBL006C 543 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YOR111WYOR111W 699 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 ODC2YOR222W 924 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 IME2YJL106W 1938 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 OPT1YJL212C 2400 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 SSK22YCR073C 3996 nt5.54□□□□□ -1.52
DDI1P40087 ZWF1YNL241C 1518 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 HAP2YGL237C 798 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 RGT1YKL038W 3513 nt5.53□□□□□ -1.52
DDI1P40087 YEH1YLL012W 1722 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 GCG1YER163C 699 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 COG1YGL223C 1254 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 LDS1YAL018C 978 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 AAT2YLR027C 1257 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 POR1YNL055C 852 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 PUS4YNL292W 1212 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 HIR1YBL008W 2523 nt5.52□□□□□ -1.53
DDI1P40087 RSC2YLR357W 2670 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 MDH3YDL078C 1032 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 RPS2YGL123W 765 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ECM14YHR132C 1293 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 GLC8YMR311C 690 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 EMW1YNL313C 2715 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 SAL1YNL083W 1485 nt5.51□□□□□ -1.53
DDI1P40087 UIP5YKR044W 1332 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YPK2YMR104C 2034 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 VTC2YFL004W 2487 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 SIP2YGL208W 1248 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YKR045CYKR045C 552 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 PKC1YBL105C 3456 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ERC1YHR032W 1746 nt5.5□□□□□ -1.53
DDI1P40087 BIO3YNR058W 1443 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ECM3YOR092W 1842 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YDL057WYDL057W 987 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YEL068CYEL068C 333 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 MRPS16YPL013C 366 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 TFB4YPR056W 1017 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 MSS1YMR023C 1581 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 RRN3YKL125W 1884 nt5.49□□□□□ -1.53
DDI1P40087 VPS1YKR001C 2115 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 RME1YGR044C 903 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 SRY1YKL218C 981 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YLR317WYLR317W 435 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YPR114WYPR114W 948 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 HSF1YGL073W 2502 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 KDX1YKL161C 1302 nt5.48□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ATG4YNL223W 1485 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ERG8YMR220W 1356 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 TAX4YJL083W 1815 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 YDL023CYDL023C 321 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 SDH4YDR178W 546 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 HAP3YBL021C 435 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 MID1YNL291C 1647 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 DIA3YDL024C 1407 nt5.47□□□□□ -1.53
DDI1P40087 MPH3YJR160C 1809 nt5.46□□□□□ -1.53
DDI1P40087 ENT2YLR206W 1842 nt5.46□□□□□ -1.53
DDI1P40087 PHO86YJL117W 936 nt5.46□□□□□ -1.54
DDI1P40087 PYC1YGL062W 3537 nt5.46□□□□□ -1.54
DDI1P40087 GPT2YKR067W 2232 nt5.46□□□□□ -1.54
DDI1P40087 MDM31YHR194W 1740 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 ISN1YOR155C 1353 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 IMA2YOL157C 1770 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 CDC34YDR054C 888 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 TSR2YLR435W 618 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 ERI1YPL096C-A 207 nt5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms